Инспекцията се извършва в активно за стопанството време през годината. Най-често това е по време на вегетацията или беритбата на културите/по време на активния сезон за пчелите.
Всяка биологична ферма трябва да се проверява поне веднъж годишно. Лицето, което извършва инспекцията, представлява контролиращото лице. Отговорност на инспектора е да провери дали програмата на стопанството точно отразява дейността му, дали фермерът спазва плана, както и да открива нарушения. Инспекторите са обучени да извършват критичен преглед на всички аспекти на органичната операция и да поддържат строга конфиденциалност. Предоставената от Вас информация за добива, продажбите или земеделските практики няма да бъде споделяна с никого, освен с контролиращото лице и при изрично изискване от страна на държавен орган.
По време на проверката трябва да предоставите на инспектора пълен достъп до Вашето стопанство, включително всички производствени помещения и офиси. Може да бъдат обявени допълнителни проверки, с или без предупреждение, по преценка на контролиращото лице или компетентния орган. На инспектора трябва да бъде осигурен достъп до всички обекти на стопанството, а не само до частта, която подлежи на сертификация.
Една от най-важните отговорности на инспектора е да проверява записите, които документират вашите земеделски практики. По-конкретно, инспекторът ще разгледа фактури, записи за приложения на препарати за растителна защита, торове и др., продажби, реколта и добив. Инспекторът може да обясни нормативните разпоредби и изисквания, но няма право да дава съвети за това как да се прилагат различни практики в земеделието или как да се преодолеят идентифицираните несъответствия пред сертифицирането. Това разделяне между земеделския производител и контролиращото лице поддържа характера на „независима трета страна“.
В рамките на проверката, инспекторът може да вземе проби за анализ за остатъци от пестициди. Резултатите от изпитването трябва да Ви бъдат предоставени. По принцип, в биологичните продукти не трябва да се откриват пестициди, но към момента няма европейски регламент, който да установява нулево съдържание на пестициди в биологичната продукция.
По време на проверката инспекторът ще зададе въпроси относно Вашата дейност, ще посетите всеки парцел / животновъден обект / склад / помещение, ще прегледа документите и ще посочи всички области, където фермата може да не отговаря на разпоредбите. В края на проверката ще има изходно интервю, по време на което инспекторът ще прегледа всички проблемни области. След проверката инспекторът изготвя доклад и го изпраща до контролиращото лице, обикновено в рамките на 2 седмици от инспекцията. Ако не сте съгласни с направените констатации, може да отбележите в доклада забележките си, като това трябва да се случи преди да го подпишете.